Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FANCAO15360 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FANCAO15360 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FANCAO15360 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FANCAO15360 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FANCAO15360 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
FANCAO15360 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FANCAO15360 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FANCAO15360 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FANCAO15360 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FANCAO15360 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FANCAO15360 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FANCAO15360 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FANCAO15360 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FANCAO15360 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FANCAO15360 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FANCAO15360 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FANCAO15360 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FANCAO15360 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FANCAO15360 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FANCAO15360 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FANCAO15360 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FANCAO15360 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FANCAO15360 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
FANCAO15360 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FANCAO15360 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FANCAO15360 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FANCAO15360 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FANCAO15360 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FANCAO15360 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FANCAO15360 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
FANCAO15360 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FANCAO15360 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FANCAO15360 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FANCAO15360 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FANCAO15360 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
FANCAO15360 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FANCAO15360 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FANCAO15360 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FANCAO15360 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
FANCAO15360 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
FANCAO15360 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FANCAO15360 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FANCAO15360 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FANCAO15360 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FANCAO15360 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FANCAO15360 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FANCAO15360 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FANCAO15360 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
FANCAO15360 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
FANCAO15360 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
FANCAO15360 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
FANCAO15360 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
FANCAO15360 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
FANCAO15360 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
FANCAO15360 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
FANCAO15360 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FANCAO15360 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FANCAO15360 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
FANCAO15360 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FANCAO15360 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FANCAO15360 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FANCAO15360 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FANCAO15360 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FANCAO15360 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FANCAO15360 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
FANCAO15360 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FANCAO15360 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
FANCAO15360 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
FANCAO15360 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FANCAO15360 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
FANCAO15360 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FANCAO15360 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
FANCAO15360 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FANCAO15360 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FANCAO15360 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FANCAO15360 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FANCAO15360 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FANCAO15360 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
FANCAO15360 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FANCAO15360 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FANCAO15360 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FANCAO15360 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FANCAO15360 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FANCAO15360 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FANCAO15360 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FANCAO15360 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
FANCAO15360 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FANCAO15360 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FANCAO15360 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FANCAO15360 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
FANCAO15360 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FANCAO15360 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FANCAO15360 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FANCAO15360 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FANCAO15360 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FANCAO15360 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FANCAO15360 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FANCAO15360 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
FANCAO15360 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms