Protein–RNA interactions for Protein: O14715

RGPD8, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD8O14715 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms