Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F3O00716 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F3O00716 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F3O00716 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F3O00716 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F3O00716 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F3O00716 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F3O00716 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
E2F3O00716 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
E2F3O00716 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
E2F3O00716 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
E2F3O00716 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
E2F3O00716 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
E2F3O00716 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F3O00716 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F3O00716 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F3O00716 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F3O00716 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F3O00716 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F3O00716 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F3O00716 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F3O00716 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F3O00716 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F3O00716 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F3O00716 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F3O00716 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F3O00716 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F3O00716 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F3O00716 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F3O00716 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F3O00716 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F3O00716 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F3O00716 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F3O00716 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F3O00716 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F3O00716 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F3O00716 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F3O00716 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F3O00716 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F3O00716 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F3O00716 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F3O00716 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F3O00716 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F3O00716 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F3O00716 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F3O00716 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F3O00716 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F3O00716 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F3O00716 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F3O00716 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F3O00716 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F3O00716 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F3O00716 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F3O00716 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F3O00716 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F3O00716 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F3O00716 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F3O00716 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F3O00716 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F3O00716 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F3O00716 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F3O00716 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F3O00716 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F3O00716 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F3O00716 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F3O00716 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F3O00716 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F3O00716 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F3O00716 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F3O00716 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F3O00716 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F3O00716 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F3O00716 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F3O00716 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F3O00716 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F3O00716 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F3O00716 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F3O00716 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F3O00716 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F3O00716 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F3O00716 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F3O00716 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F3O00716 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F3O00716 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F3O00716 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F3O00716 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F3O00716 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F3O00716 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F3O00716 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F3O00716 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F3O00716 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F3O00716 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F3O00716 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F3O00716 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F3O00716 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F3O00716 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F3O00716 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F3O00716 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F3O00716 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F3O00716 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms