Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms