Protein–RNA interactions for Protein: H7C417

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C417 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H7C417 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H7C417 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H7C417 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H7C417 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H7C417 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H7C417 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H7C417 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H7C417 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H7C417 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H7C417 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H7C417 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H7C417 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H7C417 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H7C417 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H7C417 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H7C417 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H7C417 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H7C417 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H7C417 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H7C417 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H7C417 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H7C417 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H7C417 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H7C417 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H7C417 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H7C417 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H7C417 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H7C417 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H7C417 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H7C417 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H7C417 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H7C417 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H7C417 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H7C417 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H7C417 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H7C417 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H7C417 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H7C417 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H7C417 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H7C417 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H7C417 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H7C417 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H7C417 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H7C417 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H7C417 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H7C417 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H7C417 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H7C417 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H7C417 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H7C417 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H7C417 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H7C417 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H7C417 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H7C417 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H7C417 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H7C417 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H7C417 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H7C417 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H7C417 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H7C417 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H7C417 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H7C417 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H7C417 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H7C417 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H7C417 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H7C417 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H7C417 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H7C417 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H7C417 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H7C417 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H7C417 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H7C417 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H7C417 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H7C417 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H7C417 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H7C417 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H7C417 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H7C417 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H7C417 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H7C417 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H7C417 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H7C417 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H7C417 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
H7C417 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H7C417 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
H7C417 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H7C417 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H7C417 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H7C417 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
H7C417 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H7C417 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H7C417 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
H7C417 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H7C417 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H7C417 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H7C417 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H7C417 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H7C417 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H7C417 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms