Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
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