Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms