Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms