Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
VGLL3A8MV65 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
VGLL3A8MV65 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VGLL3A8MV65 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VGLL3A8MV65 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VGLL3A8MV65 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VGLL3A8MV65 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VGLL3A8MV65 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VGLL3A8MV65 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VGLL3A8MV65 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VGLL3A8MV65 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms