Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms