Protein–RNA interactions for Protein: A6NK58

LIPT2, Putative lipoyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT2A6NK58 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms