Protein–RNA interactions for Protein: A6NDU8

C5orf51, UPF0600 protein C5orf51, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf51A6NDU8 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms