Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms