Protein–RNA interactions for Protein: A0A0C4DH30

IGHV3-16, Immunoglobulin heavy variable 3-16 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-16A0A0C4DH30 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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IGHV3-16A0A0C4DH30 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IGHV3-16A0A0C4DH30 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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