Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms