Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms