Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KNSTRNQ9Y448 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms