Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms