Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y282

ERGIC3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC3Q9Y282 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERGIC3Q9Y282 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms