Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms