Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM35Q9UPQ4 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM35Q9UPQ4 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM35Q9UPQ4 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM35Q9UPQ4 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM35Q9UPQ4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM35Q9UPQ4 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM35Q9UPQ4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM35Q9UPQ4 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM35Q9UPQ4 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM35Q9UPQ4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM35Q9UPQ4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM35Q9UPQ4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM35Q9UPQ4 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM35Q9UPQ4 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM35Q9UPQ4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM35Q9UPQ4 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM35Q9UPQ4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM35Q9UPQ4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM35Q9UPQ4 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM35Q9UPQ4 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM35Q9UPQ4 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM35Q9UPQ4 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM35Q9UPQ4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM35Q9UPQ4 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM35Q9UPQ4 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM35Q9UPQ4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM35Q9UPQ4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM35Q9UPQ4 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM35Q9UPQ4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM35Q9UPQ4 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM35Q9UPQ4 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM35Q9UPQ4 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM35Q9UPQ4 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM35Q9UPQ4 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM35Q9UPQ4 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM35Q9UPQ4 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM35Q9UPQ4 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM35Q9UPQ4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM35Q9UPQ4 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM35Q9UPQ4 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM35Q9UPQ4 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM35Q9UPQ4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM35Q9UPQ4 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM35Q9UPQ4 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM35Q9UPQ4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM35Q9UPQ4 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM35Q9UPQ4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM35Q9UPQ4 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM35Q9UPQ4 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM35Q9UPQ4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM35Q9UPQ4 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM35Q9UPQ4 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM35Q9UPQ4 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM35Q9UPQ4 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM35Q9UPQ4 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM35Q9UPQ4 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM35Q9UPQ4 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM35Q9UPQ4 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM35Q9UPQ4 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM35Q9UPQ4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM35Q9UPQ4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM35Q9UPQ4 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM35Q9UPQ4 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM35Q9UPQ4 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
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