Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms