Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.2 ms