Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms