Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms