Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R7

SUCLA2, Succinate--CoA ligase [ADP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLA2Q9P2R7 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SUCLA2Q9P2R7 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SUCLA2Q9P2R7 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SUCLA2Q9P2R7 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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