Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAPAQ9P0L0 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms