Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZV6

MSRB1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB1Q9NZV6 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MSRB1Q9NZV6 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms