Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ42

PSENEN, Gamma-secretase subunit PEN-2, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSENENQ9NZ42 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSENENQ9NZ42 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSENENQ9NZ42 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSENENQ9NZ42 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSENENQ9NZ42 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSENENQ9NZ42 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSENENQ9NZ42 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSENENQ9NZ42 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSENENQ9NZ42 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PSENENQ9NZ42 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSENENQ9NZ42 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSENENQ9NZ42 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSENENQ9NZ42 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSENENQ9NZ42 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PSENENQ9NZ42 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSENENQ9NZ42 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSENENQ9NZ42 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSENENQ9NZ42 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSENENQ9NZ42 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSENENQ9NZ42 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSENENQ9NZ42 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSENENQ9NZ42 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSENENQ9NZ42 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSENENQ9NZ42 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSENENQ9NZ42 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSENENQ9NZ42 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSENENQ9NZ42 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSENENQ9NZ42 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSENENQ9NZ42 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSENENQ9NZ42 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSENENQ9NZ42 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSENENQ9NZ42 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSENENQ9NZ42 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSENENQ9NZ42 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSENENQ9NZ42 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSENENQ9NZ42 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSENENQ9NZ42 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSENENQ9NZ42 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSENENQ9NZ42 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSENENQ9NZ42 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSENENQ9NZ42 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PSENENQ9NZ42 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSENENQ9NZ42 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSENENQ9NZ42 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PSENENQ9NZ42 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSENENQ9NZ42 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PSENENQ9NZ42 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PSENENQ9NZ42 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSENENQ9NZ42 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PSENENQ9NZ42 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PSENENQ9NZ42 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSENENQ9NZ42 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PSENENQ9NZ42 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSENENQ9NZ42 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSENENQ9NZ42 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSENENQ9NZ42 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSENENQ9NZ42 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSENENQ9NZ42 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSENENQ9NZ42 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PSENENQ9NZ42 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSENENQ9NZ42 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSENENQ9NZ42 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSENENQ9NZ42 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSENENQ9NZ42 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSENENQ9NZ42 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSENENQ9NZ42 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSENENQ9NZ42 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSENENQ9NZ42 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSENENQ9NZ42 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSENENQ9NZ42 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSENENQ9NZ42 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSENENQ9NZ42 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSENENQ9NZ42 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSENENQ9NZ42 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSENENQ9NZ42 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PSENENQ9NZ42 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSENENQ9NZ42 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSENENQ9NZ42 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSENENQ9NZ42 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSENENQ9NZ42 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSENENQ9NZ42 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PSENENQ9NZ42 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PSENENQ9NZ42 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSENENQ9NZ42 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSENENQ9NZ42 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PSENENQ9NZ42 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSENENQ9NZ42 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSENENQ9NZ42 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSENENQ9NZ42 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSENENQ9NZ42 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSENENQ9NZ42 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSENENQ9NZ42 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSENENQ9NZ42 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PSENENQ9NZ42 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSENENQ9NZ42 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSENENQ9NZ42 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSENENQ9NZ42 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSENENQ9NZ42 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSENENQ9NZ42 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PSENENQ9NZ42 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms