Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NKIRAS2Q9NYR9 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms