Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms