Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms