Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms