Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms