Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0U4

RAB1B, Ras-related protein Rab-1B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1BQ9H0U4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109 ms