Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms