Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MTMR12Q9C0I1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MTMR12Q9C0I1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MTMR12Q9C0I1 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MTMR12Q9C0I1 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MTMR12Q9C0I1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MTMR12Q9C0I1 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MTMR12Q9C0I1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MTMR12Q9C0I1 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MTMR12Q9C0I1 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MTMR12Q9C0I1 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MTMR12Q9C0I1 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MTMR12Q9C0I1 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MTMR12Q9C0I1 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MTMR12Q9C0I1 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MTMR12Q9C0I1 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MTMR12Q9C0I1 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
MTMR12Q9C0I1 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MTMR12Q9C0I1 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
MTMR12Q9C0I1 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MTMR12Q9C0I1 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MTMR12Q9C0I1 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MTMR12Q9C0I1 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms