Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms