Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms