Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms