Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms