Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms