Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW11

MXD3, Max dimerization protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MXD3Q9BW11 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MXD3Q9BW11 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MXD3Q9BW11 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MXD3Q9BW11 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MXD3Q9BW11 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MXD3Q9BW11 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MXD3Q9BW11 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MXD3Q9BW11 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MXD3Q9BW11 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MXD3Q9BW11 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MXD3Q9BW11 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MXD3Q9BW11 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MXD3Q9BW11 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MXD3Q9BW11 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MXD3Q9BW11 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MXD3Q9BW11 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MXD3Q9BW11 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MXD3Q9BW11 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MXD3Q9BW11 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MXD3Q9BW11 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MXD3Q9BW11 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MXD3Q9BW11 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MXD3Q9BW11 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MXD3Q9BW11 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MXD3Q9BW11 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MXD3Q9BW11 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MXD3Q9BW11 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MXD3Q9BW11 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MXD3Q9BW11 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MXD3Q9BW11 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MXD3Q9BW11 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MXD3Q9BW11 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MXD3Q9BW11 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MXD3Q9BW11 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MXD3Q9BW11 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MXD3Q9BW11 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MXD3Q9BW11 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MXD3Q9BW11 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MXD3Q9BW11 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MXD3Q9BW11 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MXD3Q9BW11 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MXD3Q9BW11 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MXD3Q9BW11 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MXD3Q9BW11 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MXD3Q9BW11 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms