Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms