Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR3CQ9BUI4 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR3CQ9BUI4 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR3CQ9BUI4 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR3CQ9BUI4 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR3CQ9BUI4 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR3CQ9BUI4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR3CQ9BUI4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR3CQ9BUI4 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR3CQ9BUI4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR3CQ9BUI4 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR3CQ9BUI4 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR3CQ9BUI4 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR3CQ9BUI4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR3CQ9BUI4 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR3CQ9BUI4 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR3CQ9BUI4 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR3CQ9BUI4 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR3CQ9BUI4 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR3CQ9BUI4 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR3CQ9BUI4 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR3CQ9BUI4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR3CQ9BUI4 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR3CQ9BUI4 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLR3CQ9BUI4 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLR3CQ9BUI4 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLR3CQ9BUI4 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLR3CQ9BUI4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLR3CQ9BUI4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLR3CQ9BUI4 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLR3CQ9BUI4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLR3CQ9BUI4 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLR3CQ9BUI4 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLR3CQ9BUI4 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLR3CQ9BUI4 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLR3CQ9BUI4 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
POLR3CQ9BUI4 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLR3CQ9BUI4 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLR3CQ9BUI4 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLR3CQ9BUI4 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLR3CQ9BUI4 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLR3CQ9BUI4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLR3CQ9BUI4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLR3CQ9BUI4 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLR3CQ9BUI4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLR3CQ9BUI4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLR3CQ9BUI4 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLR3CQ9BUI4 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLR3CQ9BUI4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLR3CQ9BUI4 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLR3CQ9BUI4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLR3CQ9BUI4 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLR3CQ9BUI4 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLR3CQ9BUI4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLR3CQ9BUI4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLR3CQ9BUI4 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLR3CQ9BUI4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
POLR3CQ9BUI4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLR3CQ9BUI4 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLR3CQ9BUI4 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLR3CQ9BUI4 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLR3CQ9BUI4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLR3CQ9BUI4 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLR3CQ9BUI4 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLR3CQ9BUI4 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLR3CQ9BUI4 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLR3CQ9BUI4 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLR3CQ9BUI4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLR3CQ9BUI4 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
POLR3CQ9BUI4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
POLR3CQ9BUI4 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
POLR3CQ9BUI4 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
POLR3CQ9BUI4 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
POLR3CQ9BUI4 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
POLR3CQ9BUI4 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
POLR3CQ9BUI4 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
POLR3CQ9BUI4 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
POLR3CQ9BUI4 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
POLR3CQ9BUI4 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
POLR3CQ9BUI4 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
POLR3CQ9BUI4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
POLR3CQ9BUI4 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
POLR3CQ9BUI4 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
POLR3CQ9BUI4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
POLR3CQ9BUI4 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
POLR3CQ9BUI4 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
POLR3CQ9BUI4 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
POLR3CQ9BUI4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
POLR3CQ9BUI4 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
POLR3CQ9BUI4 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
POLR3CQ9BUI4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
POLR3CQ9BUI4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
POLR3CQ9BUI4 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
POLR3CQ9BUI4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
POLR3CQ9BUI4 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
POLR3CQ9BUI4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
POLR3CQ9BUI4 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
POLR3CQ9BUI4 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
POLR3CQ9BUI4 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
POLR3CQ9BUI4 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms