Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms