Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERPUD2Q9BSE4 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms