Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.4 ms