Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms