Protein–RNA interactions for Protein: Q99616

CCL13, C-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL13Q99616 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms